oprk_human

NAME

4DJH

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

oprk_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
D
S
P
I
Q
I
F
R
G
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
P
G
P
T
C
A
P
S
A
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
L
P
P
N
S
S
A
W
F
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
G
W
A
E
P
D
S
N
G
40
 
 
                
                   
S
A
G
S
E
D
A
Q
L
E
50
                   
            TM1  
P
A
H
I
S
P
A
I
P
V
60
                   
                   
I
I
T
A
V
Y
S
V
V
F
70
                   
                   
V
V
G
L
V
G
N
S
L
V
80
                   
                   
M
F
V
I
I
R
Y
T
K
M
90
                   
ICL1 TM2      
K
T
A
T
N
I
Y
I
F
N
100
                   
                   
L
A
L
A
D
A
L
V
T
T
110
                   
                   
T
M
P
F
Q
S
T
V
Y
L
120
                   
    ECL1 TM3  
M
N
S
W
P
F
G
D
V
L
130
       
 
          
                   
C
K
I
V
I
S
I
D
Y
Y
140
                   
                   
N
M
F
T
S
I
F
T
L
T
150
                   
                   
M
M
S
V
D
R
Y
I
A
V
160
                   
    ICL2        
C
H
P
V
K
A
L
D
F
R
170
                   
TM4              
T
P
L
K
A
K
I
I
N
I
180
                   
                   
C
I
W
L
L
S
S
S
V
G
190
                   
                   
I
S
A
I
V
L
G
G
T
K
200
                   
ECL2            
V
R
E
D
V
D
V
I
E
C
210
                   
              TM5
S
L
Q
F
P
D
D
D
Y
S
220
                   
                   
W
W
D
L
F
M
K
I
C
V
230
                   
                   
F
I
F
A
F
V
I
P
V
L
240
                   
                   
I
I
I
V
C
Y
T
L
M
I
250
                   
            ICL3
L
R
L
K
S
V
R
L
L
S
260
 
 
 
              
  TM6            
G
S
R
E
K
D
R
N
L
R
270
                   
                   
R
I
T
R
L
V
L
V
V
V
280
                   
                   
A
V
F
V
V
C
W
T
P
I
290
                   
                   
H
I
F
I
L
V
E
A
L
G
300
                   
ECL3 TM7      
S
T
S
H
S
T
A
A
L
S
310
                   
                   
S
Y
Y
F
C
I
A
L
G
Y
320
                   
                   
T
N
S
S
L
N
P
I
L
Y
330
                   
      H8          
A
F
L
D
E
N
F
K
R
C
340
                   
                   
F
R
D
F
C
F
P
L
K
M
350
               
 
 
C-term        
R
M
E
R
Q
S
T
S
R
V
360
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
N
T
V
Q
D
P
A
Y
L
370
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
D
I
D
G
M
N
K
P
V
380
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV proteas
 
                  
  N-term      
 
G
S
E
D
A
Q
L
E
P
51
                   
          TM1    
A
H
I
S
P
A
I
P
V
I
61
                   
                   
I
T
A
V
Y
S
V
V
F
V
71
                   
                   
V
G
L
V
G
N
S
L
V
M
81
                   
            ICL1
F
V
I
I
R
Y
T
K
M
K
91
                   
TM2              
T
A
T
N
I
Y
I
F
N
L
101
                   
                   
A
L
A
D
A
L
V
T
T
T
111
                   
                   
M
P
F
Q
S
T
V
Y
L
M
121
                   
  ECL1 TM3    
N
S
W
P
F
G
D
V
L
C
131
     
 
            
                   
K
I
V
L
S
I
D
Y
Y
N
141
                   
                   
M
F
T
S
I
F
T
L
T
M
151
                   
                   
M
S
V
D
R
Y
I
A
V
C
161
                   
  ICL2          
H
P
V
K
A
L
D
F
R
T
171
                   
TM4              
P
L
K
A
K
I
I
N
I
C
181
                   
                   
I
W
L
L
S
S
S
V
G
I
191
                   
            ECL2
S
A
I
V
L
G
G
T
K
V
201
                   
                   
R
E
D
V
D
V
I
E
C
S
211
                   
            TM5  
L
Q
F
P
D
D
D
Y
S
W
221
                   
                   
W
D
L
F
M
K
I
C
V
F
231
                   
                   
I
F
A
F
V
I
P
V
L
I
241
                   
                   
I
I
V
C
Y
T
L
M
I
L
251
                 
          ICL3
R
L
K
S
V
R
L
L
S
260
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
            
    TM6        
G
 
R
E
K
D
R
N
L
269
                   
                   
R
R
I
T
R
L
V
L
V
V
279
                   
                   
V
A
V
F
V
V
C
W
T
P
289
                   
                   
I
H
I
F
I
L
V
E
A
L
299
                   
  ECL3 TM7    
G
S
T
S
H
S
T
A
A
L
309
                   
                   
S
S
Y
Y
F
C
I
A
L
G
319
                   
                   
Y
T
N
S
S
L
N
P
I
L
329
                   
        H8        
Y
A
F
L
D
E
N
F
K
R
339
                   
                   
C
F
R
D
F
C
F
P
L
K
349
                 
 
C-term        
M
R
M
E
R
Q
S
T
S
 

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
 
ICL3
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV pr
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
 
 
ICL3 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 


DIAGRAMS

ICL1 T K M K ICL1ECL1 S W P F ECL1ICL2 P V K A L D F R ICL2ECL2 G T K V R E D V D V I E C S L Q F P D D ECL2ICL3 R L L S G ICL3ECL3 S T S H ECL3N-term M D S P I Q I F R G E P G P T C A P S A C L P P N S S A W F P G W A E P D S N G S A G S E D A Q L E P A H I S P N-termC-term P L K M R M E R Q S T S R V R N T V Q D P A Y L R D I D G M N K P V C-term A I P V I I T A V Y S V V F V V G L V G N S L V M F V I I R Y T A T N I Y I F N L A L A D A L V T T T M P F Q S T V Y L M N G D V L C K I V I S I D Y Y N M F T S I F T L T M M S V D R Y I A V C H T P L K A K I I N I C I W L L S S S V G I S A I V L G D Y S W W D L F M K I C V F I F A F V I P V L I I I V C Y T L M I L R L K S V S R E K D R N L R R I T R L V L V V V A V F V V C W T P I H I F I L V E A L G S T A A L S S Y Y F C I A L G Y T N S S L N P I L Y A F L D E N F R D F K R C F C F

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
135 |  I L

DELETIONS

  • from 1 to 42
  • from 262 to 262
  • from 359 to 380

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_2 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: TEV protease
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_3 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_4 261:263
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect pFastBac1 and Bac-to-bac

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by TEV protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 40 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 6.0-6.0

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown PEG 400 28-32 % v/v
    unknown Sodium Citrate pH 5.8-6.4 100 mM
    unknown Potassium Nitrate 350-450 mM
    Detergent
    detergent DDM 0.03 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.006 %w/v