ntr1_rat

NAME

4GRV

ORGANISM

Rat (Rattus norvegicus)

PROTEIN NAME

ntr1_rat

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
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T4 Lysozyme
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
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His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 N-term
 
 
 
TM1
 
ICL1
 
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ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
 
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
 
 
 
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 K S L Q ICL1ECL1 H H P W A F ECL1ICL2 P F K A K T L M ICL2ECL2 G L Q N R S G D G T H P G G L V C T P I V D ECL2ICL3 R V C T V G T H N G L E H S T F N M T I E ICL3ECL3 S D E Q W ECL3N-term M H L N S S V P Q G T P G E P D A Q P F S G P Q S E M E A T F L A L S L S N G S G N T S E S D T A G P N S D L D V N T D N-termC-term P G W R H R R K K R P T F S R K P N S M S S N H A F S T S A T R E T L Y C-term I Y S K V L V T A I Y L A L F V V G T V G N S V T A F T L A R K S L Q S T V H Y H L G S L A L S D L L I L L L A M P V E L Y N F I W V G D A G C R G Y Y F L R D A C T Y A T A L N V A S L S V E R Y L A I C H S R S R T K K F I S A I W L A S A L L A I P M L F T M T A T V K V V I Q V N T F M S F L F P M L V I S I L N T V I A N K L T V M V H Q A A E Q G P G R V Q A L R H G V L V L R A V V I A F V V C W L P Y H V R R L M F C Y I T T F L F D F Y H Y F Y M L T N A L F Y V S S A I N P I L Y N L V S A N F L S L C F R Q V T L A C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
86 |  A L
166 |  E A
215 |  G A
310 |  L A
358 |  F A
360 |  V A

DELETIONS

  • from 1 to 42
  • from 269 to 299
  • from 397 to 424

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 269:299
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: linker

    Name: GSGS
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_3 296:296
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Tni PRO (Trichoplusia ni) cell lines Insect pFastBac1

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    additive CHS 0.3 %w/v
    detergent LMNG 3 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    NONE None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 20-25 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 7.0-7.0

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown PEG 400 20.8 % v/v
    unknown NaK tartrate 43 mM
    unknown HEPES pH 7.0 80 mM
    unknown TCEP 2 mM
    Detergent
    detergent LMNG 0.003 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.0003 %w/v