glp1r_human

NAME

5VEX

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

glp1r_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
A
G
A
P
G
P
L
R
L
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
L
L
L
L
G
M
V
G
R
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
G
P
R
P
Q
G
A
T
V
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
L
W
E
T
V
Q
K
W
R
40
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
Y
R
R
Q
C
Q
R
S
L
50
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
E
D
P
P
P
A
T
D
L
60
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
F
C
N
R
T
F
D
E
Y
A
70
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
W
P
D
G
E
P
G
S
F
80
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
N
V
S
C
P
W
Y
L
P
90
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
W
A
S
S
V
P
Q
G
H
V
100
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
R
F
C
T
A
E
G
L
W
110
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
Q
K
D
N
S
S
L
P
W
120
 
 
 
 
 
 
 
      
                   
R
D
L
S
E
C
E
E
S
K
130
                   
              TM1
R
G
E
R
S
S
P
E
E
Q
140
                   
                   
L
L
F
L
Y
I
I
Y
T
V
150
                   
                   
G
Y
A
L
S
F
S
A
L
V
160
                   
                   
I
A
S
A
I
L
L
G
F
R
170
                   
ICL1 TM2      
H
L
H
C
T
R
N
Y
I
H
180
                   
                   
L
N
L
F
A
S
F
I
L
R
190
   
 
    
 
        
                   
A
L
S
V
F
I
K
D
A
A
200
       
 
 
 
 
 
 
            ECL1
L
K
W
M
Y
S
T
A
A
Q
210
 
 
 
              
                   
Q
H
Q
W
D
G
L
L
S
Y
220
       
 
          
      TM3        
Q
D
S
L
S
C
R
L
V
F
230
   
 
              
                   
L
L
M
Q
Y
C
V
A
A
N
240
                   
                   
Y
Y
W
L
L
V
E
G
V
Y
250
             
 
 
 
                   
L
Y
T
L
L
A
F
S
V
L
260
                   
TM4              
S
E
Q
W
I
F
R
L
Y
V
270
 
                  
                   
S
I
G
W
G
V
P
L
L
F
280
                   
                   
V
V
P
W
G
I
V
K
Y
L
290
                   
    ECL2        
Y
E
D
E
G
C
W
T
R
N
300
                   
  TM5            
S
N
M
N
Y
W
L
I
I
R
310
           
 
 
    
                   
L
P
I
L
F
A
I
G
V
N
320
                   
                   
F
L
I
F
V
R
V
I
C
I
330
                   
                   
V
V
S
K
L
K
A
N
L
M
340
         
 
 
      
TM6              
C
K
T
D
I
K
C
R
L
A
350
                   
                   
K
S
T
L
T
L
I
P
L
L
360
 
                  
                   
G
T
H
E
V
I
F
A
F
V
370
                   
  ECL3   TM7  
M
D
E
H
A
R
G
T
L
R
380
                   
                   
F
I
K
L
F
T
E
L
S
F
390
                   
                   
T
S
F
Q
G
L
M
V
A
I
400
                   
          H8      
L
Y
C
F
V
N
N
E
V
Q
410
                   
                   
L
E
F
R
K
S
W
E
R
W
420
                   
                   
R
L
E
H
L
H
I
Q
R
D
430
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  C-term      
S
S
M
K
P
L
K
C
P
T
440
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
S
L
S
S
G
A
T
A
G
450
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
S
M
Y
T
A
T
C
Q
A
460
 
 
 
     
S
C
S
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (b562R
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV proteas
 
                  
  N-term      
 
E
S
K
R
G
E
R
S
S
136
                   
  TM1            
P
E
E
Q
L
L
F
L
Y
I
146
                   
                   
I
Y
T
V
G
Y
A
L
S
F
156
                   
                   
S
A
L
V
I
A
S
A
I
L
166
                   
      ICL1 TM2
L
G
F
R
H
L
H
C
T
R
176
                   
                   
N
Y
I
H
L
N
L
F
A
S
186
           
 
    
 
                   
F
I
L
R
A
L
C
V
F
F
196
               
 
                 
K
D
A
A
L
K
W
M
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
GSG              
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
ECL1        
W
D
G
L
L
S
Y
Q
221
     
 
            
    TM3          
D
S
L
A
C
R
L
V
F
L
231
 
 
                
                   
L
C
Q
Y
C
V
A
A
N
Y
241
                   
                   
Y
W
L
L
V
E
G
V
Y
L
251
           
 
             
Y
T
L
L
A
F
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lysozyme
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
       
TM4  
S
E
Q
W
264
           
 
      
                   
I
F
R
L
Y
V
A
I
G
W
274
                   
                   
G
V
P
L
L
F
V
V
P
W
284
                   
                   
G
I
V
K
Y
L
Y
E
D
E
294
                   
ECL2       TM5
G
C
W
T
R
N
S
N
M
N
304
                   
                   
Y
W
L
I
I
R
L
P
I
L
314
   
 
 
            
                   
F
A
C
I
V
N
F
L
I
F
324
                   
                   
V
R
V
I
C
I
V
V
S
K
334
                   
          ICL3 TM6
L
K
A
N
L
M
C
K
T
D
344
 
 
 
              
               
I
A
F
R
L
A
K
S
T
L
354
           
 
      
                   
T
L
I
P
L
L
C
T
H
E
364
                   
                   
V
I
F
A
F
V
M
D
E
H
374
                   
ECL3 TM7      
A
R
G
T
L
R
F
I
K
L
384
                   
                   
F
T
E
L
S
F
T
S
F
Q
394
                   
                   
G
L
M
V
A
I
L
Y
C
F
404
                   
  H8              
V
N
N
E
V
Q
L
E
F
R
414
                   
                   
K
S
W
E
R
W
R
L
E
H
424
             
 
               
L
H
I
Q
R
D
S
 

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
 
 
 
 
 
 
TM2
 
 
 
 
 
 
 
 
ECL1
 
 
 
 
TM3
 
 
 
ICL2
 
 
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
TM5
 
ICL3
 
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV pr
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
 
 
 
 
 
TM2 
  
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
GSG
 
  
 
 
 
 
TM5
 
ICL3
 
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
H8 


DIAGRAMS

ICL1 R H L H ICL1ECL1 T A A Q Q H Q W D G L L S Y Q D S ECL1ICL2 S V L ICL2ECL2 D E G C W T R N S ECL2ICL3 M ICL3ECL3 D E H A R ECL3N-term M A G A P G P L R L A L L L L G M V G R A G P R P Q G A T V S L W E T V Q K W R E Y R R Q C Q R S L T E D P P P A T D L F C N R T F D E Y A C W P D G E P G S F V N V S C P W Y L P W A S S V P Q G H V Y R F C T A E G L W L Q K D N S S L P W R D L S E C E E S K R G E R S S P N-termC-term S M K P L K C P T S S L S S G A T A G S S M Y T A T C Q A S C S C-term E E Q L L F L Y I I Y T V G Y A L S F S A L V I A S A I L L G F C T R N Y I H L N L F A S F I L R A L S V F I K D A A L K W M Y S L S C R L V F L L M Q Y C V A A N Y Y W L L V E G V Y L Y T L L A F S E Q W I F R L Y V S I G W G V P L L F V V P W G I V K Y L Y E N M N Y W L I I R L P I L F A I G V N F L I F V R V I C I V V S K L K A N L C K T D I K C R L A K S T L T L I P L L G T H E V I F A F V M G T L R F I K L F T E L S F T S F Q G L M V A I L Y C F V N N E F R K W R L I Q R V Q L E S W E R E H L H D S

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
193 |  S C
196 |  I F
225 |  S A
233 |  M C
271 |  S A
317 |  I C
318 |  G I
346 |  K A
347 |  C F
361 |  G C

DELETIONS

  • from 1 to 127
  • from 205 to 213
  • from 258 to 260
  • from 432 to 463

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:No
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: BRIL (b562RIL)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: TEV protease
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_2 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: linker

    Name: GSG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_3 205:213
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_4 258:260
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac-to-Bac Baculovirus, pFastBac1

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Proteolysis by TEV protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 30 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 5.0-5.8

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    detergent DDM 0.01 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.002 %w/v
    Precipitant
    PEG 400 38–40 % v/v
    Additional
    ammonium acetate 0.4-0.45 M
    sodium acetate, pH 5.0–5.8 0.1 M