q9wtk1_cavpo

NAME

5X33

ORGANISM

Guinea pig (Cavia porcellus)

PROTEIN NAME

q9wtk1_cavpo

SOURCE

TREMBL

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
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T4 Lysozyme
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                
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PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(6)        

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
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FLAG
 
 
 N-term
 
TM1
 
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ECL2
 
 
 
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
 
 
C-term
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreSci
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(6)


DIAGRAMS

ICL1 M R K R ICL1ECL1 T W S F ECL1ICL2 P F L S Q K V R ICL2ECL2 K V V K L T N E T D L C L A V Y P ECL2ICL3 R F H R ICL3ECL3 G T L D Q ECL3N-term M D R N T T T R A A S P S G S N N-termC-term G V G F V A K L L E A T G S E A F S T R R G G T L A Q T V K G I P M A P E P G A S G S L D G L K Q S E S D C-term T F I P L L A M I L L S V S M V V G L P G N T F V V W S I L K R S V T A L M V L N L A L A D L A V L L T A P F F L H F L T W H K L A G C R L C H Y I C G V S M Y A S V L L I T A M S L D R S L A V A S T K T A A R W L L V G I W G A S F L L A T P V L A F R S D R H K A F H L L F E A F T G F V V P F L I V V A S Y A D I S R R L R V R R R R T G R L V V I I I L A F A A F W L P Y H V V D L V E G S R V L A S K Q Q L R N A R K V C I A L A F L S S S V N P L L Y A C A G G G L L R S A

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
83 |  H G
88 |  K G
212 |  V A
309 |  S A

DELETIONS

  • from 1 to 14

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: alpha factor
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 213:213
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(6)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Pichia Pastoris P. pastoris SMD1163 Yeast Stable cell line

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent LMNG 1.3 %w/v
    additive CHS 0.013 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by HRV 3C protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 10–50 mg/ml
    Temperature: 4°C
    ph : 8.5-9.0

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    Detergent LMNG 0.02 %w/v
    Lipid
    Lipid CHS 0.01 %w/v
    Additional
    Buffer bicine buffer (pH 8.5–9.0) 100.0 mM
    ammonium phosphate 50-75 mM
    ammonium formate 75-100 mM
    3-methyl -1,5-heptanediol 2-4 %v/v
    Precipitant
    precipitant PEG 300 22.5–30 %v/v