oprk_human

NAME

6B73

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

oprk_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
D
S
P
I
Q
I
F
R
G
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
P
G
P
T
C
A
P
S
A
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
L
P
P
N
S
S
A
W
F
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
G
W
A
E
P
D
S
N
G
40
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
A
G
S
E
D
A
Q
L
E
50
 
 
 
              
            TM1  
P
A
H
I
S
P
A
I
P
V
60
                   
                   
I
I
T
A
V
Y
S
V
V
F
70
                   
                   
V
V
G
L
V
G
N
S
L
V
80
                   
                   
M
F
V
I
I
R
Y
T
K
M
90
                   
ICL1 TM2      
K
T
A
T
N
I
Y
I
F
N
100
                   
                   
L
A
L
A
D
A
L
V
T
T
110
                   
                   
T
M
P
F
Q
S
T
V
Y
L
120
                   
    ECL1 TM3  
M
N
S
W
P
F
G
D
V
L
130
       
 
          
                   
C
K
I
V
I
S
I
D
Y
Y
140
                   
                   
N
M
F
T
S
I
F
T
L
T
150
                   
                   
M
M
S
V
D
R
Y
I
A
V
160
                   
    ICL2        
C
H
P
V
K
A
L
D
F
R
170
                   
TM4              
T
P
L
K
A
K
I
I
N
I
180
                   
                   
C
I
W
L
L
S
S
S
V
G
190
                   
                   
I
S
A
I
V
L
G
G
T
K
200
                   
ECL2            
V
R
E
D
V
D
V
I
E
C
210
                   
              TM5
S
L
Q
F
P
D
D
D
Y
S
220
                   
                   
W
W
D
L
F
M
K
I
C
V
230
                   
                   
F
I
F
A
F
V
I
P
V
L
240
                   
                   
I
I
I
V
C
Y
T
L
M
I
250
                   
            ICL3
L
R
L
K
S
V
R
L
L
S
260
                   
  TM6            
G
S
R
E
K
D
R
N
L
R
270
                   
                   
R
I
T
R
L
V
L
V
V
V
280
                   
                   
A
V
F
V
V
C
W
T
P
I
290
                   
                   
H
I
F
I
L
V
E
A
L
G
300
                   
ECL3 TM7      
S
T
S
H
S
T
A
A
L
S
310
                   
                   
S
Y
Y
F
C
I
A
L
G
Y
320
                   
                   
T
N
S
S
L
N
P
I
L
Y
330
                   
      H8          
A
F
L
D
E
N
F
K
R
C
340
                   
                   
F
R
D
F
C
F
P
L
K
M
350
               
 
 
C-term        
R
M
E
R
Q
S
T
S
R
V
360
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
N
T
V
Q
D
P
A
Y
L
370
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
D
I
D
G
M
N
K
P
V
380
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV proteas
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (b562R
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
GS                
 
                  
  N-term TM1
 
I
S
P
A
I
P
V
I
I
62
                   
                   
T
A
V
Y
S
V
V
F
V
V
72
                   
                   
G
L
V
G
N
S
L
V
M
F
82
                   
          ICL1  
V
I
I
R
Y
T
K
M
K
T
92
                   
TM2              
A
T
N
I
Y
I
F
N
L
A
102
                   
                   
L
A
D
A
L
V
T
T
T
M
112
                   
                   
P
F
Q
S
T
V
Y
L
M
N
122
                   
ECL1 TM3      
S
W
P
F
G
D
V
L
C
K
132
   
 
              
                   
I
V
L
S
I
D
Y
Y
N
M
142
                   
                   
F
T
S
I
F
T
L
T
M
M
152
                   
                   
S
V
D
R
Y
I
A
V
C
H
162
                   
ICL2            
P
V
K
A
L
D
F
R
T
P
172
                   
TM4              
L
K
A
K
I
I
N
I
C
I
182
                   
                   
W
L
L
S
S
S
V
G
I
S
192
                   
          ECL2  
A
I
V
L
G
G
T
K
V
R
202
                   
                   
E
D
V
D
V
I
E
C
S
L
212
                   
          TM5    
Q
F
P
D
D
D
Y
S
W
W
222
                   
                   
D
L
F
M
K
I
C
V
F
I
232
                   
                   
F
A
F
V
I
P
V
L
I
I
242
                   
                   
I
V
C
Y
T
L
M
I
L
R
252
                   
        ICL3    
L
K
S
V
R
L
L
S
G
S
262
                   
TM6              
R
E
K
D
R
N
L
R
R
I
272
                   
                   
T
R
L
V
L
V
V
V
A
V
282
                   
                   
F
V
V
C
W
T
P
I
H
I
292
                   
                   
F
I
L
V
E
A
L
G
S
T
302
                   
ECL3 TM7      
S
H
S
T
A
A
L
S
S
Y
312
                   
                   
Y
F
C
I
A
L
G
Y
T
N
322
                   
                   
S
S
L
N
P
I
L
Y
A
F
332
                   
  H8              
L
D
E
N
F
K
R
C
F
R
342
                   
        C-term
D
F
C
F
P
L
K
M
R
M
352
           
 
             
E
R
Q
S
T
S
 

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV pr
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
GS
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 


DIAGRAMS

ICL1 T K M K ICL1ECL1 S W P F ECL1ICL2 P V K A L D F R ICL2ECL2 G T K V R E D V D V I E C S L Q F P D D ECL2ICL3 R L L S G ICL3ECL3 S T S H ECL3N-term M D S P I Q I F R G E P G P T C A P S A C L P P N S S A W F P G W A E P D S N G S A G S E D A Q L E P A H I S P N-termC-term P L K M R M E R Q S T S R V R N T V Q D P A Y L R D I D G M N K P V C-term A I P V I I T A V Y S V V F V V G L V G N S L V M F V I I R Y T A T N I Y I F N L A L A D A L V T T T M P F Q S T V Y L M N G D V L C K I V I S I D Y Y N M F T S I F T L T M M S V D R Y I A V C H T P L K A K I I N I C I W L L S S S V G I S A I V L G D Y S W W D L F M K I C V F I F A F V I P V L I I I V C Y T L M I L R L K S V S R E K D R N L R R I T R L V L V V V A V F V V C W T P I H I F I L V E A L G S T A A L S S Y Y F C I A L G Y T N S S L N P I L Y A F L D E N F R D F K R C F C F

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
135 |  I L

DELETIONS

  • from 1 to 53
  • from 359 to 380

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_2 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: TEV protease
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_3 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: BRIL (b562RIL)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_4 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: linker

    Name: GS
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_5 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac - to - Bac Baculovirus Expression System (Invitrogen)

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by TEV protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 30.0 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 6.5-7.0

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    Detergent DDM 0.05 % w/v
    Lipid
    Lipid CHS 0.01 %w/v
    Additional
    Buffer Bis-tris pH 6.5-7.0 100.0 mM
    magnesium sulfate hydrate 140-200 mM
    sodium citrate tribasic dehydrate 100.0 mM
    Manganese(II) chloride tetrahydrate, 100.0 mM
    PEG 400 28–30 % v/v