opsd_human
NAME
6CMO
ORGANISM
Human (Homo sapiens)
PROTEIN NAME
opsd_human
SOURCE
SWISSPROT
SEQUENCE
Perspective:
Wild-type
Construct
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| 281 | |||||||||
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Perspective:
Wild-type
Construct
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DIAGRAMS
MUTATIONS
| Position | Wild-type | Mutated |
|---|
DELETIONS
MODIFICATIONS
AUXILIARY PROTEINS
Protein_type: tag
Name: FLAG
Sequence: None
Deletions:
Positions: N-term_0 None:None
Presence in Crystal:YES
Remarks: None
Protein_type: tag
Name: His(8)
Sequence: None
Deletions:
Positions: N-term_1 None:None
Presence in Crystal:YES
Remarks: None
Protein_type: tag
Name: sfGFP
Sequence: None
Deletions:
Positions: N-term_1 None:None
Presence in Crystal:YES
Remarks: None
Protein_type: prot_cleavage
Name: TEV protease
Sequence: None
Deletions:
Positions: N-term_2 None:None
Presence in Crystal:YES
Remarks: None
Protein_type: fusion
Name: BRIL (b562RIL)
Sequence: None
Deletions:
Positions: N-term_3 None:None
Presence in Crystal:YES
Remarks: None
EXPRESSION
| Expression method | Host cell type | Host cell | Remarks |
|---|---|---|---|
| Baculovirus | Sf9 | Insect | BestBac |
SOLUBILIZATION
| Solvent type | Item | Concentration |
|---|---|---|
| detergent | DDM | 0.5 %w/v |
| additive | CHS | 0.1 %w/v |
Remarks:
PURIFICATION
| Purification type | Description |
|---|---|
| Proteolysis by TEV protease | None |
Remarks:None
CRYSTALLIZATION
METHOD: Cryo-EM
TYPE: FEI TITAN Krios microscope,Gatan K2 Summit direct electron camera,GIF-quantum energy filter (Gatan) ()
PROTEIN CONCENTRATION: 9.0 mg/ml
Temperature: 4°C
ph : 7.2-7.2
Remarks: 19,368 K2 movies
Chemical lists
| Type | Item | Concentration |
|---|---|---|
| Detergent | ||
| Digitonin | 0.1 % v/v | |
| Additional | ||
| Buffer | HEPES, pH 7.2 | 20.0 mM |
| NaCl | 100.0 mM | |
| Apyrase | 1.0 U/ml | |